32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2071 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  100 
 
 		 68 aa  136  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  59.62 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3886  hypothetical protein  46.38 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  48.21 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  48.15 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  41.54 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  46 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  43.4 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  39.62 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  53.66 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  59.38 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  51.06 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  48.94 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  44.9 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  45.28 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3222  hypothetical protein  38.98 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  45.24 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  45.65 
 
 		 95 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2797  hypothetical protein  39.29 
 
 		 71 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000554604  hitchhiker  0.00000544866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1181  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0913  hypothetical protein  32.26 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0255062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2619  hypothetical protein  44.9 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0235815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0845  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0108043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>