18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3530 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  634    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  46.75 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  36.62 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  32 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  29.25 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  32.48 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  34.82 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  33.13 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  29.52 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  28.44 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  25.97 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.08 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  25.89 
 
 		 355 aa  49.3  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  23.76 
 
 		 391 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.87 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  19.54 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.5 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>