31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3017 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  350  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  72.32 
 
 
177 aa  263  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  61.83 
 
 
167 aa  148  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  57.14 
 
 
131 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  40.12 
 
 
174 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  45.97 
 
 
150 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  41.45 
 
 
163 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  45.83 
 
 
185 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  35.59 
 
 
207 aa  101  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  46.09 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  42.61 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  35.52 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  39.55 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  34.66 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  34.66 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  41.96 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  36.03 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  37.5 
 
 
258 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  29.81 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  33.64 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  35.82 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  32.17 
 
 
273 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  31.4 
 
 
248 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  30.83 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  42.31 
 
 
62 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  34.43 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  39.81 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  28.97 
 
 
261 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  28.02 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0578  hypothetical protein  40.51 
 
 
86 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0767023  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  41.3 
 
 
58 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>