20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1169 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1169  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 135 aa  268  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1769  4-oxalocrotonate tautomerase  51.11 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0159397  normal  0.0361346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1150  4-oxalocrotonate tautomerase  55.04 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2880  4-oxalocrotonate tautomerase  51.97 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3847  4-oxalocrotonate tautomerase  54.33 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.544573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4924  4-oxalocrotonate tautomerase  54.33 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3464  4-oxalocrotonate tautomerase  50.75 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560795 
 
 
-
 
NC_003296  RS02204  hypothetical protein  51.18 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4893  hypothetical protein  51.13 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364576  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3080  4-oxalocrotonate tautomerase  44.96 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3581  4-oxalocrotonate tautomerase  53.38 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4359  4-oxalocrotonate tautomerase  48.03 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0717  hypothetical protein  39.37 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.132967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4629  4-oxalocrotonate tautomerase  43.2 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3620  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3911  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3691  hypothetical protein  29.23 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.205332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1991  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.956857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>