24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2970 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 108 aa  226  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  79.63 
 
 		 108 aa  186  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  77.78 
 
 		 108 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  71.3 
 
 		 108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  65.74 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  64.81 
 
 		 108 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  60.19 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  58.33 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  59.26 
 
 		 108 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  54.63 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0089  NIPSNAP family containing protein  40.19 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  34.86 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0535  NIPSNAP family containing protein  31.71 
 
 		 267 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  29.46 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  29.46 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5103  hypothetical protein  30.84 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4035  NIPSNAP family containing protein  30.86 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000172271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6516  NIPSNAP family containing protein  30.56 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732065  normal  0.0663973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  27.88 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  29.63 
 
 		 104 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  25.93 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  30.17 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1878  NIPSNAP family containing protein  27.16 
 
 		 259 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  27.36 
 
 		 108 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>