18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2481 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1640  hypothetical protein  67.13 
 
 		 217 aa  307  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7150  hypothetical protein  31.68 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3873  hypothetical protein  33.66 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266806  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1686  gp11  32.14 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2230  phage major tail subunit  34.23 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1053  gp11  32.67 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2257  hypothetical protein  39.56 
 
 		 514 aa  62  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2176  major tail protein  32.71 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2886  major tail protein  32.71 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1195  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3389  hypothetical protein  27.78 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000807621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4087  tail protein 3  27.41 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282078 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  30.77 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1689  hypothetical protein  27.06 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.536925  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0637  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0929  hypothetical protein  32.5 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0863  hypothetical protein  36.71 
 
 		 123 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>