47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2885 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  64.38 
 
 		 227 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  37.69 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  37.56 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  33.5 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  35.81 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  36.95 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  40.09 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  36.84 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  34.18 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  53.61 
 
 		 101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  36.89 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  34.48 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  29.61 
 
 		 244 aa  98.6  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  31.44 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  34.98 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  34.98 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  31.66 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  30.65 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  31.02 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  30.09 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  27.49 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  27.27 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  26.8 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  27.09 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  27.09 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  26.22 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  25.36 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  25 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  25.33 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  36 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  29.32 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  27.23 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  26.19 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  23.15 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  24.55 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  26.24 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  27.73 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  24.3 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  25.25 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  26.07 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  20.96 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  23.67 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  22.6 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00258  ATPase  73.08 
 
 		 40 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  26.57 
 
 		 572 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>