48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1786 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  100 
 
 		 417 aa  862    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  71.43 
 
 		 420 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  70.95 
 
 		 423 aa  625  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  70.48 
 
 		 435 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  66.24 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  63 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  62.72 
 
 		 441 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  59.39 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  59.64 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  61.1 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  61.36 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  59.64 
 
 		 443 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  58.88 
 
 		 445 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  59.64 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  59.38 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  59.9 
 
 		 448 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  53.88 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  53.63 
 
 		 422 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  55.65 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  52.35 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  53.5 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  52.55 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  53.08 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  49.75 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  50.63 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  47.47 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  50 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  49.37 
 
 		 422 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  46.88 
 
 		 428 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  42.69 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  42.48 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  42.72 
 
 		 480 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  44.7 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  41.69 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  42.56 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  41.8 
 
 		 429 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  40.89 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  42.78 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  39.13 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  22.67 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  22.71 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  25.46 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  25 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.6 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  22.06 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  20.6 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  25.57 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  22.34 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>