64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05809 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  85.86 
 
 
198 aa  362  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  73.06 
 
 
202 aa  298  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  72.92 
 
 
195 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  52.17 
 
 
203 aa  197  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  50.56 
 
 
208 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  46.56 
 
 
206 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  47.9 
 
 
211 aa  174  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  40.39 
 
 
242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  38.54 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  39.79 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  35.57 
 
 
207 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  40.64 
 
 
201 aa  124  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  39.18 
 
 
210 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  39.04 
 
 
201 aa  121  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  35.18 
 
 
203 aa  121  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  37.78 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  38.46 
 
 
202 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  36.67 
 
 
202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  37.22 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  36.67 
 
 
202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  37.22 
 
 
202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  37.5 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  35.45 
 
 
201 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
226 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  35.64 
 
 
208 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  38.93 
 
 
211 aa  111  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  37.23 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  39.34 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  35.9 
 
 
200 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  32.11 
 
 
209 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  31.49 
 
 
209 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  31.67 
 
 
209 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  31.67 
 
 
209 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  34.97 
 
 
202 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  31.67 
 
 
209 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  31.67 
 
 
209 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  31.67 
 
 
209 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  31.67 
 
 
209 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  34.92 
 
 
202 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  34.39 
 
 
202 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  32.02 
 
 
211 aa  101  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  34.43 
 
 
212 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  39.27 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  36.57 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  32 
 
 
228 aa  98.2  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  32.18 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  31.91 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  33.73 
 
 
209 aa  94.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  36.36 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  37.27 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  33.73 
 
 
209 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  31.79 
 
 
215 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  31.43 
 
 
194 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  32.31 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  33.17 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  31.79 
 
 
215 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  33.15 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  29.89 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  32.3 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  29.81 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.218767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>