27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001703 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  627  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  87.71 
 
 		 301 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  55.41 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  71.28 
 
 		 195 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  38.24 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  37.4 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  37.4 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  37.82 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  36.99 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  36.71 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  37.97 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  36.84 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  37.39 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  38.26 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  34.18 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  34.96 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  34.24 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  34.18 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  34.6 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  36.6 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  30.63 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  33.89 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  33.48 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  26.22 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  24.66 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  23.84 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  27.34 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>