24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2134 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  72.82 
 
 		 301 aa  279  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  71.28 
 
 		 301 aa  274  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  66.67 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  36.81 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  36.07 
 
 		 279 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  36.07 
 
 		 279 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  36.07 
 
 		 279 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  35.52 
 
 		 293 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  36.07 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  36.61 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  34.97 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  34.97 
 
 		 279 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  35.52 
 
 		 279 aa  130  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  36.26 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  33.88 
 
 		 279 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  32.24 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  32.07 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  35.16 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  34.78 
 
 		 283 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  33.51 
 
 		 335 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  32.42 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  23.24 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>