27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0424 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  617  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  56.08 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  55.41 
 
 
301 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  66.67 
 
 
195 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  35.59 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  34.48 
 
 
279 aa  168  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  34.1 
 
 
279 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  34.48 
 
 
279 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  35.22 
 
 
279 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  35.22 
 
 
279 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  34.82 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  33.72 
 
 
279 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  34.82 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  35.19 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  32.1 
 
 
277 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  34.78 
 
 
299 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  33.45 
 
 
286 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  32.57 
 
 
279 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  33.76 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  33.59 
 
 
283 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  31.03 
 
 
277 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  32.23 
 
 
335 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  30.14 
 
 
301 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  26.03 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  22.73 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  21.05 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  26.32 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>