28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0719 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  587  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  64.75 
 
 
279 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  63.94 
 
 
277 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  65.52 
 
 
279 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  64.37 
 
 
279 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  65.38 
 
 
279 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  65 
 
 
279 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  65 
 
 
279 aa  361  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  64.37 
 
 
279 aa  359  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  64.37 
 
 
279 aa  359  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  64.62 
 
 
293 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  61.4 
 
 
277 aa  350  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  61.28 
 
 
277 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  59.02 
 
 
286 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  59.02 
 
 
278 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  56 
 
 
281 aa  318  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  32.91 
 
 
301 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  33.59 
 
 
298 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  35.15 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  33.89 
 
 
301 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  30.34 
 
 
335 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  30.22 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  34.78 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  25.33 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  24.41 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  26.26 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  28.44 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1557  hypothetical protein  33.66 
 
 
150 aa  43.5  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>