27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0682 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  36.4 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  33.45 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  24.58 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  26.87 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  32.76 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  30.6 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  24.64 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  31.85 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  26.29 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  26.29 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  31.85 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  25.86 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  25.21 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  25.86 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  31.11 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  32.46 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  30.08 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  30.08 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  29.75 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  29.63 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  25.66 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  24.15 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  24.64 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  25.33 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  27.74 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  23.78 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>