27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3796 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  85.2 
 
 		 277 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  76.05 
 
 		 286 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  73.06 
 
 		 279 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  73.06 
 
 		 279 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  73.8 
 
 		 279 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  72.36 
 
 		 279 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  72.69 
 
 		 293 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  71.96 
 
 		 279 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  72.32 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  72.32 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  72.32 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  70.04 
 
 		 278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  63.33 
 
 		 277 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  60.23 
 
 		 281 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  61.4 
 
 		 283 aa  328  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  35.11 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  34.18 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  32.4 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  34.6 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  33.76 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  29.74 
 
 		 335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  32.24 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  30.08 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  32.06 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  29.61 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  28.48 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>