28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0968 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  99.64 
 
 
279 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  99.64 
 
 
279 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  98.21 
 
 
293 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  93.19 
 
 
279 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  89.96 
 
 
279 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  89.61 
 
 
279 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  89.96 
 
 
279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  88.89 
 
 
279 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  70.65 
 
 
277 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  71.96 
 
 
277 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  68.89 
 
 
286 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  65.11 
 
 
277 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  65.94 
 
 
278 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  63.64 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  65.38 
 
 
283 aa  340  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  33.48 
 
 
301 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  37.82 
 
 
301 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  36.84 
 
 
301 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  30.71 
 
 
335 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  34.82 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  32.53 
 
 
299 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  36.07 
 
 
195 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  25.86 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  24.77 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  29.9 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  28.68 
 
 
334 aa  59.3  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1557  hypothetical protein  35.82 
 
 
150 aa  42  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>