27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3068 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  97.85 
 
 		 279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  98.57 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  94.98 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  90.68 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  90.32 
 
 		 279 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  90.32 
 
 		 279 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  89.96 
 
 		 279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  89.96 
 
 		 293 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  73.06 
 
 		 277 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  69.93 
 
 		 277 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  68.52 
 
 		 286 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  66.19 
 
 		 277 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  65.94 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  62.21 
 
 		 281 aa  352  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  64.37 
 
 		 283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  34.67 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  37.39 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  37.25 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  34.48 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  32.76 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  32.53 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2134  hypothetical protein  34.97 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  31.11 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  26.11 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  28.35 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  27.67 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>