26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4100 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4100  membrane-fusion protein  100 
 
 		 334 aa  679    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0810  hypothetical protein  35.29 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.866367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03586  hypothetical protein  25.54 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0673  hypothetical protein  27.03 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0904  hypothetical protein  24.26 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3039  hypothetical protein  27.73 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3796  hypothetical protein  29.61 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  normal  0.967815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2884  hypothetical protein  31.15 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0808  hypothetical protein  27.36 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0869  hypothetical protein  24.26 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0682  hypothetical protein  27.74 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000215879  normal  0.0246998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0788  hypothetical protein  29.29 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0947  hypothetical protein  29.87 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3068  hypothetical protein  26.11 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0934  hypothetical protein  26.18 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0309509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0668  hypothetical protein  24.52 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3402  hypothetical protein  29.46 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4036  hypothetical protein  23.24 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.64379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0960  hypothetical protein  29.46 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3722  hypothetical protein  28.68 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0968  hypothetical protein  28.68 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.765758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0395  hypothetical protein  32.35 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001703  hypothetical protein  32.31 
 
 		 301 aa  52.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00770  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0424  hypothetical protein  23.4 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0719  hypothetical protein  24.41 
 
 		 283 aa  43.1  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000983282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>