25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000817 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  756    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  51.57 
 
 		 380 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  50 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  37.89 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  37.11 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  34.51 
 
 		 398 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  35.77 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  31.48 
 
 		 436 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  31.71 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  31.48 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  31.48 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  32.89 
 
 		 396 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  31.48 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  34.09 
 
 		 400 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  32.22 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  30.32 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  30.29 
 
 		 397 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  30.7 
 
 		 415 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  29.07 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  28.78 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  35.29 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  27.72 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  28.34 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  27.6 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  27.19 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>