22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2614 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  547  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0326  glycosyl transferase  58.59 
 
 
269 aa  314  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  30.96 
 
 
788 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  32.12 
 
 
773 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  26.15 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  30.1 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  29.07 
 
 
717 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  27.95 
 
 
743 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4383  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  23.24 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0822765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0658  hypothetical protein  29.93 
 
 
519 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  0.0369536 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45039  predicted protein  29.41 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  31.03 
 
 
907 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00360  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
540 aa  52  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06534  MIPC synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA39]  28.02 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43796  predicted protein  29.7 
 
 
371 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00529  hypothetical protein  28.3 
 
 
210 aa  48.9  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800515  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39480  predicted protein  29.27 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83423  predicted protein  27.61 
 
 
405 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.582312  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  28.24 
 
 
377 aa  45.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0657  hypothetical protein  21.89 
 
 
535 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.86756  normal  0.15093 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28420  hypothetical protein  30.97 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25794  predicted protein  24.1 
 
 
292 aa  42  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>