264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0065 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0065  thiosulfate ABC transporter, periplasmic thiosulfate-binding protein  100 
 
 
333 aa  683    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1066  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.42 
 
 
335 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0167374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3292  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.73 
 
 
335 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1099  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.73 
 
 
335 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1005  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  81.82 
 
 
335 aa  564  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.432024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0997  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  82.12 
 
 
335 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.961901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3012  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  85.03 
 
 
335 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.615219  normal  0.0264263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3092  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  85.03 
 
 
335 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0179342  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3189  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  85.03 
 
 
335 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.480893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3599  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  84.08 
 
 
335 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  73.94 
 
 
337 aa  514  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1373  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  64.86 
 
 
334 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3457  thiosulfate transporter subunit  62.23 
 
 
340 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1299  thiosulfate transporter subunit  59.94 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2769  thiosulfate transporter subunit  60.62 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2951  thiosulfate transporter subunit  60 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339938 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1408  thiosulfate transporter subunit  60.62 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2810  thiosulfate transporter subunit  61.59 
 
 
338 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2680  thiosulfate transporter subunit  61.9 
 
 
338 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2704  thiosulfate transporter subunit  61.59 
 
 
338 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1002  thiosulfate transporter subunit  60.95 
 
 
342 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.428472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02325  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1236  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.89 
 
 
338 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02286  hypothetical protein  61.89 
 
 
338 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0765  thiosulfate transporter subunit  62.21 
 
 
342 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2589  thiosulfate transporter subunit  61.27 
 
 
338 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2711  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2580  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2638  thiosulfate transporter subunit  62.21 
 
 
338 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3655  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2561  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1254  thiosulfate transporter subunit  61.89 
 
 
338 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2797  thiosulfate transporter subunit  61.24 
 
 
338 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  61.15 
 
 
336 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  58.81 
 
 
335 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  57.49 
 
 
335 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3333  thiosulphate-binding protein  61.34 
 
 
345 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885845  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1854  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.39 
 
 
334 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.334824  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1330  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein, putative  57.84 
 
 
334 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1290  putative sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  57.52 
 
 
334 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1798  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.78 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655228  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4318  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.73 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.980547  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2331  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.23 
 
 
345 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  49.39 
 
 
329 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3697  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic binding protein CysP  55.56 
 
 
330 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3432  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.56 
 
 
330 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.94 
 
 
341 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  50.96 
 
 
338 aa  322  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  52.46 
 
 
337 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  48.79 
 
 
329 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.33 
 
 
341 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  47.27 
 
 
330 aa  318  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.62 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.15 
 
 
340 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  51.76 
 
 
346 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.95 
 
 
337 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.72 
 
 
341 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.31 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.81 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.4 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  49.09 
 
 
331 aa  311  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.81 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  46.99 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  48.48 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.88 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.78 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.57 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  47.53 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  50.16 
 
 
337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.16 
 
 
337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.16 
 
 
337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.25 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.25 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  46.08 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  46.58 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  44.24 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.84 
 
 
337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  46.58 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  47.42 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  47.27 
 
 
332 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  47.59 
 
 
329 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  47.2 
 
 
342 aa  299  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.51 
 
 
329 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  45.68 
 
 
335 aa  298  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.56 
 
 
332 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  48.73 
 
 
354 aa  298  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.54 
 
 
337 aa  298  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  46.25 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.25 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  46.25 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  46.89 
 
 
329 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  46.25 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  46.25 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  46.39 
 
 
329 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  46.25 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  46.25 
 
 
329 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.09 
 
 
339 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  48.07 
 
 
337 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.79 
 
 
339 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  47.53 
 
 
343 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>