39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0595 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0595  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000906711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0417  membrane protein  49.47 
 
 		 196 aa  185  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1498  hypothetical protein  51.65 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000581479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000092136  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0023  hypothetical protein  28.88 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.0202898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  33.61 
 
 		 256 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  24.52 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  28.46 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  25.28 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  27.46 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  25.14 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  28.68 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  27.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  24.87 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  26 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  25.15 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  25.65 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  27.22 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  28.35 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  25.14 
 
 		 200 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  26.28 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  25 
 
 		 220 aa  42  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  26.28 
 
 		 200 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  24.79 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  26.06 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  26.06 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  26.06 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  26.06 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  26.06 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.2 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>