28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1498 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1498  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  377  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000581479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0417  membrane protein  48.95 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0595  hypothetical protein  53.61 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000906711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3080  hypothetical protein  31.69 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000092136  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0023  hypothetical protein  34.76 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.0202898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  27.78 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  27.78 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  27.78 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  29.6 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  29.46 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  33.09 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  28.68 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.09 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  34.06 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  34.06 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  34.06 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  34.06 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03240  uncharacterized membrane-associated protein  27.36 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.479554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  32.19 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  33.64 
 
 
204 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  31.58 
 
 
192 aa  41.2  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>