33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0239 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  100 
 
 
159 aa  316  7e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  54.96 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  60 
 
 
153 aa  124  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  59.63 
 
 
153 aa  123  9e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  50.76 
 
 
197 aa  123  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  57.8 
 
 
157 aa  120  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  58.72 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  46.56 
 
 
236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  46.92 
 
 
240 aa  104  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  43.8 
 
 
135 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  44.27 
 
 
335 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  43.44 
 
 
135 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  42.06 
 
 
134 aa  100  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  42.62 
 
 
135 aa  100  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  42.62 
 
 
135 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  41.73 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  41.32 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  44.19 
 
 
240 aa  97.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  43.65 
 
 
148 aa  97.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  42.03 
 
 
236 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  44 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  46.4 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  45.13 
 
 
138 aa  90.9  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  48.65 
 
 
134 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  44.35 
 
 
139 aa  85.5  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  45.38 
 
 
128 aa  85.5  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  48.57 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  42.86 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  35.78 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  29.27 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  34.04 
 
 
111 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  29.06 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>