44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1936 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  77.7 
 
 
278 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2294  hypothetical protein  73.38 
 
 
287 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0248697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  74.36 
 
 
275 aa  426  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0955  methyltransferase-like protein  51.38 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  44.95 
 
 
297 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  41.58 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37177  predicted protein  32.63 
 
 
239 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0215141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04179  hypothetical protein  36.76 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2036  hypothetical protein  34.74 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1957  hypothetical protein  34.74 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0392  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  37.41 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  26.67 
 
 
186 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  31.21 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  30.7 
 
 
413 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 
706 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.7 
 
 
705 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 
706 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  24.88 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  29.03 
 
 
397 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 
706 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.43 
 
 
706 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25 
 
 
709 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  36.56 
 
 
400 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.82 
 
 
705 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  29.82 
 
 
409 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.65 
 
 
712 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26 
 
 
711 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.48 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  32.56 
 
 
394 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  36.59 
 
 
186 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  29.46 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  36.56 
 
 
400 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.76 
 
 
707 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  31.29 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  36.56 
 
 
400 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.35 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  26.98 
 
 
396 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  29.75 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.25 
 
 
711 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.97 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.97 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  26.57 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>