33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0767 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 
188 aa  375  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.599543 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  87.43 
 
 
193 aa  297  5e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  89.36 
 
 
190 aa  295  3e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  85.47 
 
 
189 aa  288  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  51.01 
 
 
216 aa  162  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  55.56 
 
 
185 aa  160  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  55.71 
 
 
187 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  54.79 
 
 
216 aa  150  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  51.61 
 
 
194 aa  142  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  50.34 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  47.83 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  47.68 
 
 
203 aa  137  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  48.97 
 
 
196 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  49.65 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  46.98 
 
 
194 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  46.98 
 
 
194 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  46.54 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  50 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  46.2 
 
 
199 aa  131  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  49.66 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  48.84 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  43.42 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  46.25 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  46.58 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  47.95 
 
 
196 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  43.8 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  45.45 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  47.37 
 
 
196 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  44.83 
 
 
205 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  46.21 
 
 
192 aa  111  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  45.14 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  44.37 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.162573 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  45.45 
 
 
203 aa  92  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>