13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3597 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  31.79 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  29.85 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  27.03 
 
 
769 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  30.23 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4015  hypothetical protein  29.24 
 
 
175 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  28.46 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  27.08 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  29.71 
 
 
736 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  25.44 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  28.46 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>