21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2698 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2698  TadE family protein  100 
 
 
342 aa  677    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  43.56 
 
 
336 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2304  TadE family protein  31.75 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2111  TadE family protein  28.57 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  29.76 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2294  TadE family protein  33.69 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4350  TadE family protein  30.57 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380237  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6880  TadE family protein  29.56 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  normal  0.128629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2301  hypothetical protein  30.68 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0639  hypothetical protein  26.71 
 
 
215 aa  59.7  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0713  hypothetical protein  27.23 
 
 
228 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0743  hypothetical protein  22.35 
 
 
233 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  46.43 
 
 
136 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  44.83 
 
 
136 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  49.09 
 
 
134 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  42.31 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  39.22 
 
 
154 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32 
 
 
157 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40.74 
 
 
148 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  32.84 
 
 
177 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  35.71 
 
 
143 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>