12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0713 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0713  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0639  hypothetical protein  60 
 
 		 215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0743  hypothetical protein  54.46 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  36.44 
 
 		 278 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4350  TadE family protein  36.44 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6880  TadE family protein  36.8 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  normal  0.128629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2304  TadE family protein  36.04 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2294  TadE family protein  36.28 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2301  hypothetical protein  35.38 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  30.37 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2111  TadE family protein  31.67 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2698  TadE family protein  26.07 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>