12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4350 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4350  TadE family protein  100 
 
 		 260 aa  530  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  55.69 
 
 		 278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6880  TadE family protein  58.47 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  normal  0.128629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0713  hypothetical protein  36.44 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2304  TadE family protein  41.62 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0639  hypothetical protein  34.58 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0743  hypothetical protein  33.06 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2294  TadE family protein  39.88 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2301  hypothetical protein  39.51 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  34.46 
 
 		 336 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2111  TadE family protein  30.29 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2698  TadE family protein  30.85 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>