14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2111 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2111  TadE family protein  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  36.89 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  34.55 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6880  TadE family protein  35.48 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  normal  0.128629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2304  TadE family protein  38.51 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4350  TadE family protein  30.08 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2294  TadE family protein  38.51 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0713  hypothetical protein  33.51 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0639  hypothetical protein  32.12 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2301  hypothetical protein  35.58 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0743  hypothetical protein  27.57 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2698  TadE family protein  29.63 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  41.38 
 
 		 144 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  44.83 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>