22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1876 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  690    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  30.92 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  24.28 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  24.16 
 
 		 589 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  24.36 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  22.22 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  26.3 
 
 		 610 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  25.59 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.5 
 
 		 606 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 592 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  28.25 
 
 		 504 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  25.07 
 
 		 595 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  23.78 
 
 		 565 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 		 574 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.38 
 
 		 596 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  23.79 
 
 		 594 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  24.34 
 
 		 589 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  25.21 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  34.43 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  34.43 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  21.14 
 
 		 587 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>