29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1240 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  249  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  68.14 
 
 
113 aa  167  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  55.36 
 
 
114 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
285 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  30.63 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  32.69 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  30.48 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  25.66 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  23.68 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  25.96 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  28.72 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  28.72 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  30.56 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  31.94 
 
 
127 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  28.97 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  29.2 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  27.78 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  28.44 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  28.04 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  28.04 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  28.04 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  28.04 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  43.5  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  29.09 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  26.17 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  28.18 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  23.42 
 
 
120 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>