15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0970 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  46.29 
 
 
251 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  34.21 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  34.41 
 
 
271 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  34.2 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  33.92 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  31.7 
 
 
277 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  31.38 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  29.27 
 
 
399 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  25.27 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  27.6 
 
 
246 aa  46.2  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  29.69 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  29.05 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  43.4 
 
 
341 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>