More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0614 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0614  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
314 aa  634    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2735  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.75 
 
 
308 aa  329  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0412  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.42 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_377  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.74 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0435  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.06 
 
 
324 aa  318  5e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.187137  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0452  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 
355 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2281  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000349824  hitchhiker  0.0000000850288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 
315 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1729  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.6 
 
 
316 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.509372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.51 
 
 
315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3725  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.45 
 
 
312 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.84 
 
 
325 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1883  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.62 
 
 
321 aa  298  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0733  Ribose-phosphate diphosphokinase  50 
 
 
314 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0083  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 
327 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4537  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.5 
 
 
327 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 
314 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
312 aa  295  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.75 
 
 
316 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.57 
 
 
314 aa  295  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.73 
 
 
314 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.9 
 
 
322 aa  291  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.08 
 
 
316 aa  291  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2600  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 
313 aa  291  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.220278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.08 
 
 
313 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.22 
 
 
317 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.3 
 
 
317 aa  289  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.25 
 
 
318 aa  288  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.98 
 
 
316 aa  288  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2621  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.77 
 
 
324 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.065708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.57 
 
 
315 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0778  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.23 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.31 
 
 
314 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.09 
 
 
319 aa  285  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 
311 aa  285  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.27 
 
 
317 aa  285  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4106  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.045384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.98 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.41 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.55 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.57 
 
 
322 aa  281  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.41 
 
 
329 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.75 
 
 
312 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.75 
 
 
312 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.74 
 
 
325 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.99 
 
 
318 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.37 
 
 
319 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.69 
 
 
319 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  46.52 
 
 
321 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.4 
 
 
321 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0131  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 
318 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.166437  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.51 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000100275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.6 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.13 
 
 
320 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  45.66 
 
 
319 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.95 
 
 
321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  45.95 
 
 
321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  41.88 
 
 
327 aa  271  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.37 
 
 
324 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.37 
 
 
315 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
323 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  43.69 
 
 
317 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.16 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.09 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.78 
 
 
312 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.04 
 
 
318 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.04 
 
 
318 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.45 
 
 
331 aa  268  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.37 
 
 
309 aa  268  8e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  42.31 
 
 
338 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.16 
 
 
325 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  41.8 
 
 
313 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.73 
 
 
312 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.05 
 
 
324 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.69 
 
 
324 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.87 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.69 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.69 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.34 
 
 
330 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.04 
 
 
309 aa  266  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  46.2 
 
 
312 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.66 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.37 
 
 
330 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  43.63 
 
 
325 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.04 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  43.09 
 
 
317 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00466763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.62 
 
 
322 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>