More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1708 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1708  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0139  iron-containing alcohol dehydrogenase  76.77 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1174  iron-containing alcohol dehydrogenase  73.23 
 
 		 402 aa  390  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0564  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.93 
 
 		 399 aa  349  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00143817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1911  Iron-containing alcohol dehydrogenase  64.96 
 
 		 399 aa  338  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0894  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.35 
 
 		 399 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0578  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.35 
 
 		 402 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0654  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.96 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.48 
 
 		 402 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000124402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0563  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.14 
 
 		 358 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.165056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1193  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.25 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2051  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 		 402 aa  232  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 387 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1601  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.68 
 
 		 384 aa  155  8e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.600148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 		 387 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0928  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.5 
 
 		 364 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.04 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 		 366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.49 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.6 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 		 386 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 389 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 		 382 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3674  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 		 887 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 		 393 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 		 377 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  30.4 
 
 		 381 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 		 388 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4050  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 		 894 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0532224 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 		 384 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 		 371 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 		 387 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 		 389 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 		 387 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 393 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 		 382 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  33.33 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.21 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  31.91 
 
 		 382 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  30.4 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 		 388 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 		 358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 		 387 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 		 397 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  32.59 
 
 		 390 aa  118  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 		 383 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2855  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 865 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2540  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 865 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  31.62 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 383 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 387 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 383 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 		 387 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 399 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 393 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 		 387 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.05 
 
 		 393 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.74 
 
 		 393 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 		 382 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  32.89 
 
 		 390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 		 402 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0171  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  31.56 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  31.25 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  31.25 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 		 383 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  32.89 
 
 		 390 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0048  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 359 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0244255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25550  alcohol dehydrogenase, class IV  34.68 
 
 		 405 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 		 872 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 382 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 382 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 		 382 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 		 382 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 387 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02531  hypothetical protein  32.16 
 
 		 397 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 381 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 382 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 		 382 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>