47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3278 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  37.71 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  31.76 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  31.36 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  31.01 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  29.7 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  32.57 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  28.57 
 
 		 553 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  27.68 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  28.04 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  26.79 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  27.68 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  27.68 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  27.51 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  27.51 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  27.15 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  27.51 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  27.23 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  28.87 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3336  hypothetical protein  27 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  29.02 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  27.51 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  28.42 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  26.63 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  23.32 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  27.14 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  22.11 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  27.83 
 
 		 479 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  21.31 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.71 
 
 		 352 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  28.78 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.03 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  28.14 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.11 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  29.71 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  28.14 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  36.05 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  26.51 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.81 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  17.79 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  19.26 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  23.3 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  19.26 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  18.85 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  22.74 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.24 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.24 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>