30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3212 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  361  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  62.86 
 
 		 176 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  60.25 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  46.25 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  34.07 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  32.7 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  31.68 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  31.9 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  26.58 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  29.79 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  31.85 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  28.21 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  29.38 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  30.2 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  22.6 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  27.22 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  24.84 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  27.74 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  28.07 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  29.46 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  30 
 
 		 115 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  32.72 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  23.84 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  26.76 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  23.31 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  27.22 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  27.61 
 
 		 112 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  21.17 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>