30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2818 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2818  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.326931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0641  hypothetical protein  88.94 
 
 		 259 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.593076  normal  0.0266858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2236  hypothetical protein  87.55 
 
 		 259 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0993  hypothetical protein  86.9 
 
 		 262 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4147  hypothetical protein  78.33 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119545  hitchhiker  0.00139206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2339  hypothetical protein  91.27 
 
 		 262 aa  410  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2295  hypothetical protein  80.3 
 
 		 263 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000011125  hitchhiker  0.000111621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3382  hypothetical protein  80.61 
 
 		 262 aa  411  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1226  hypothetical protein  80 
 
 		 259 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0475  hypothetical protein  81.2 
 
 		 272 aa  400  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1661  hypothetical protein  78.07 
 
 		 272 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0357337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1314  hypothetical protein  78.49 
 
 		 264 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1448  hypothetical protein  78.49 
 
 		 264 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0430118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0562  hypothetical protein  74.63 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2918  hypothetical protein  53.2 
 
 		 251 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2998  hypothetical protein  53.66 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00986967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3290  hypothetical protein  52.8 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1524  hypothetical protein  55.45 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59130  hypothetical protein  55.56 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000119768  hitchhiker  0.00578423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4459  hypothetical protein  55.41 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1724  hypothetical protein  36.09 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.59027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4109  hypothetical protein  32.75 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.930656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0308  hypothetical protein  32.14 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000403318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0617  hypothetical protein  31.53 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3742  hypothetical protein  30.91 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3944  hypothetical protein  33.78 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00955657  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4410  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0622  hypothetical protein  32.39 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2682  hypothetical protein  24.2 
 
 		 375 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122486 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2801  hypothetical protein  21.46 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>