More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1057 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1057  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2239  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2444  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.546311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2051  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1463  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2034  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1670  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0662  translation initiation factor 1  66.67 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2954  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4823  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.407366  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5188  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4661  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 82 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0692274  normal  0.0189166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3906  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2174  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.466444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2156  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5176  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 73 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.411739  normal  0.733527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1086  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 85 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.27871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5742  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 73 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2202  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1295  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1139  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.755906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1131  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0775  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0735491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5211  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3132  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319222  normal  0.203192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5094  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0509  translation initiation factor 1  63.38 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4408  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0981  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.359493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2961  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0227177  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1356  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2388  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261522  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5765  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  62.5 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3442  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0386884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3205  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.737724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5666  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1067  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0646  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0625  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2579  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 74 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0711  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 74 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000362397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0539  translation initiation factor 1  63.38 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.3184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2992  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 74 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 75 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  62.5 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 75 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1762  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0982  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3352  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0756524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1756  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5839  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3905  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4463  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 87 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1450  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2585  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 		 85 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3899  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 87 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4360  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 87 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1312  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.108243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2139  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0312  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2872  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0587815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3704  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2439  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4193  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0587  translation initiation factor IF-1  56.34 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  55.56 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1407  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0166318  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1734  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  57.53 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1792  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1688  translation initiation factor 1  62.86 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000115833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3512  translation initiation factor IF-1  56.94 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.684385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1603  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1675  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764362  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4167  translation initiation factor IF-1  58.33 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>