32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0803 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  222  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  86.96 
 
 		 115 aa  202  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  55.65 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3467  hypothetical protein  56.9 
 
 		 116 aa  139  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  46.08 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0801  hypothetical protein  37.96 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  32.2 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  36.27 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  31.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1829  hypothetical protein  30.3 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.449896  hitchhiker  0.0000377036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.66 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.11 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.66 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  29.29 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  27.97 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  26 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  27.35 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  31.25 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  27.84 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  30.51 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  26.8 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  25.26 
 
 		 240 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  26.32 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  26.19 
 
 		 221 aa  45.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  24.05 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  23.81 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  27.08 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  26.26 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  21.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>