More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1669 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  63.32 
 
 		 321 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  57.28 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  57.55 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  56.15 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  55.76 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  55.17 
 
 		 322 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50.83 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  47.32 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  47.35 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  45.14 
 
 		 320 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  43.99 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  44.55 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  44.05 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  41.93 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.35 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  44.41 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  43.3 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  41.69 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  44.94 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  41.3 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  44.34 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.14 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  38.34 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  41.16 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  38.96 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  36.11 
 
 		 329 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  39.94 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  39.38 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  38.3 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  37.2 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  40 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  37.9 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  38.48 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  37.58 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  37.58 
 
 		 341 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  37.58 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  38.04 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.35 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  36.68 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  39.04 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  34.35 
 
 		 342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.36 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  37.19 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  39.2 
 
 		 503 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  37.42 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  36.48 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  35.98 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.69 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  35.2 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  33.33 
 
 		 330 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  36.53 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  35.31 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  35.12 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  36.25 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  37.03 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  34.38 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  37.5 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  40.19 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  36.17 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  37.11 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  41.42 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  36.47 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.95 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  36.47 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  36.47 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  33.14 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  34.98 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  34.98 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  34.98 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  36.56 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  36.56 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  36.56 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.37 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  34.81 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  35.15 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.26 
 
 		 331 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.95 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.06 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  34.28 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  33.13 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  34.28 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  43.24 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.64 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  65.98 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.9 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  28.8 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.64 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  26.43 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  29.2 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.84 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  32.26 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  30.57 
 
 		 543 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  32.89 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>