16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1064 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4057  DNA polymerase beta domain protein region  54.35 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  58.14 
 
 
128 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  42.55 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  51.06 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2738  DNA polymerase beta domain protein region  40.82 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3858  DNA polymerase beta domain protein region  44.9 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0908144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3226  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  40.43 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  51.61 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  53.33 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  46.81 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  62.96 
 
 
108 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>