14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4100 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4100  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00402166  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 11716 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  31.25 
 
 		 549 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  30 
 
 		 787 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1184 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  30 
 
 		 787 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  32.86 
 
 		 1120 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  31.82 
 
 		 645 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2041  response regulator receiver domain-containing protein  31.91 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  42.03 
 
 		 573 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.33 
 
 		 8871 aa  42  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  35.53 
 
 		 1161 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  37.5 
 
 		 593 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  30 
 
 		 685 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>