13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0899 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  100 
 
 
62 aa  123  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  51.61 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  40.68 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  40 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  41.38 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  46.94 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  45.45 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  37.93 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  42.86 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  42 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  32.79 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  47.5 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>