30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4560 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4560  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 1116 aa  2167    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4558  WD-40 repeat protein  77.16 
 
 		 1125 aa  1508    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0393  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.19 
 
 		 641 aa  278  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5130  hypothetical protein  51.01 
 
 		 290 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7647  hypothetical protein  41.97 
 
 		 311 aa  198  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3567  hypothetical protein  31.46 
 
 		 670 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.929607  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3984  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.84 
 
 		 605 aa  77.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4166  hypothetical protein  26 
 
 		 738 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.530303  normal  0.0503721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0563  hypothetical protein  25.35 
 
 		 346 aa  63.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1429  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.11 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0781  WD-40 repeat protein  34.46 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.22 
 
 		 1240 aa  55.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.37 
 
 		 1110 aa  54.7  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 1557 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  30.63 
 
 		 790 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.2 
 
 		 698 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2994  hypothetical protein  36.94 
 
 		 237 aa  52.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  37.82 
 
 		 1901 aa  52  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.95 
 
 		 1328 aa  51.6  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1047  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  25.33 
 
 		 409 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.112794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.53 
 
 		 1807 aa  49.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.33 
 
 		 1217 aa  48.5  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  33.33 
 
 		 1416 aa  48.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  45 
 
 		 919 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1211 aa  47.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1789 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.29 
 
 		 1262 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1764  hypothetical protein  34.29 
 
 		 985 aa  45.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3598  WD-40 repeat protein  32.1 
 
 		 774 aa  45.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.867901  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.15 
 
 		 1609 aa  45.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>