94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3875 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 97 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  77.32 
 
 		 96 aa  157  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  77.08 
 
 		 95 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  75 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.52 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  67.74 
 
 		 96 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  71.59 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.16 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.05 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  65.98 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.7 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.74 
 
 		 119 aa  121  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.2 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.73 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  61.11 
 
 		 94 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  65.82 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.35 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.88 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.76 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.76 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.76 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.49 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.49 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.48 
 
 		 120 aa  110  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  56.18 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.16 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.33 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.61 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.21 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.22 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 		 99 aa  104  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  55.84 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  48.81 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.46 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  47.3 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.89 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.81 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.75 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.75 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.78 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.7 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.89 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3614  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.52 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1824  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.52 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.507725  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.52 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2368  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.03 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1251  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.74 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.14 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.67 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  27.78 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3413  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.35 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00892  hypothetical protein  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.524478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.12 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1760  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.21 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.614449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2279  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00245616  normal  0.0342658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1012  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000515979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.94 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.89 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4057  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.59 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0910653  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0985  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174222  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0954  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00274651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2715  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1043  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0946  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0416889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1062  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.88139  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00886  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0979  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 106 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2245  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.9 
 
 		 113 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.028928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0710  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.17 
 
 		 99 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1398  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.071981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2693  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1263  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.57 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.692203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1600  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.94 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2394  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.31 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.864742  normal  0.0826838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2607  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.69 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000957927 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.33 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.56 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.33 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.11 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2057  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 		 102 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0497269  normal  0.357929 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.8 
 
 		 116 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2268  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.08 
 
 		 106 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>