23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1090 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  447  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  58.06 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  45.71 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  57.41 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  56.86 
 
 
216 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.704326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  46.3 
 
 
120 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.71 
 
 
1888 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0195  hypothetical protein  42.37 
 
 
111 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  42.65 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  45.16 
 
 
519 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  31.44 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4312  hypothetical protein  44.44 
 
 
99 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  47.06 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2900  hypothetical protein  38 
 
 
170 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000404833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  42.31 
 
 
118 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  43.48 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22390  hypothetical protein  42.59 
 
 
114 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1754  hypothetical protein  42.59 
 
 
117 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  42.31 
 
 
329 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0779  plectin  37.25 
 
 
399 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3736  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  hitchhiker  0.0052659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>