47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3202 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1053    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  39.28 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  40.71 
 
 		 531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  42.33 
 
 		 552 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  41.33 
 
 		 552 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  40.41 
 
 		 529 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  38.53 
 
 		 566 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  39.34 
 
 		 565 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  40 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  36.45 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  41.76 
 
 		 652 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  38.25 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  40.67 
 
 		 548 aa  280  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.97 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  39.81 
 
 		 529 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  44.38 
 
 		 533 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  39.74 
 
 		 523 aa  257  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  39.85 
 
 		 539 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.62 
 
 		 545 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  39.17 
 
 		 540 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  40.53 
 
 		 549 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.55 
 
 		 551 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  37.91 
 
 		 532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.82 
 
 		 532 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.82 
 
 		 532 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.82 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  35.57 
 
 		 555 aa  230  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.76 
 
 		 541 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.11 
 
 		 540 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.9 
 
 		 526 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  37.17 
 
 		 528 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  34.64 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  36.67 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  26.46 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.96 
 
 		 527 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.37 
 
 		 533 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  34.9 
 
 		 527 aa  171  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  35.9 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  24.33 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  31.91 
 
 		 496 aa  150  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  32 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.57 
 
 		 542 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.1 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.1 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  26.59 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  42.98 
 
 		 143 aa  84.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.45 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>