31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2537 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  577  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  63.9 
 
 
277 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  52.14 
 
 
274 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  47.03 
 
 
275 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  45.42 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  30.33 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  30.66 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  29.38 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  31.91 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  29.94 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  26.51 
 
 
429 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  34.51 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  30.12 
 
 
467 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  33.11 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  25.79 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  25.79 
 
 
298 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  25.79 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  24.69 
 
 
232 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  24.04 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  28.26 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  33.67 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  27.96 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  23.71 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  38.18 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  25.25 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  23.03 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  23.21 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  22.54 
 
 
254 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  25.13 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  25.5 
 
 
540 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  22.78 
 
 
212 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>